Ze względu na właściwości mikrofal ciepło powstaje najpierw w zewnętrznych warstwach produktu spożywczego, a następnie jest przenoszone do jego środka. Gdy produkt spożywczy jest podgrzewany z większą mocą mikrofal, może być już gorący z wierzchu, ale w środku jeszcze nie zostanie podgrzany. Przy następującym później wyrównaniu temperatury produkt spożywczy staje się cieplejszy w środku i chłodniejszy na zewnątrz.
Dlatego, szczególnie przy podgrzewaniu produktów spożywczych o zróżnicowanym składzie, takich jak np. zestaw obiadowy, wskazane jest ustawienie niższej mocy mikrofal i odpowiednio dłuższego czasu.